根據蔬菜種類和栽培條件靈活施肥，不同類型的蔬菜，硝酸鹽的累積程度有很大差異，一般是葉菜高于瓜菜，瓜菜高于果菜。另外，同一種蔬菜在不同氣候條件下，硝酸鹽含量也有差異，一般高溫強光下，硝酸鹽積累少。反之，低溫弱光下，硝酸鹽大量積累，在施肥過程中，應考慮蔬菜的種類、栽培季節和氣候條件等，掌握合理的化肥用量，確保硝酸鹽含量在無公害蔬菜的規定范圍之內。
1、人糞尿及廄肥要充分發酵腐熟，并且追肥后要澆清水沖洗。
2、化肥要深施、早施，深施可以減少氮素揮發，延長供肥時間，提高氮素利用率。早施則利于植株早發快長，延長肥效，減輕硝酸鹽積累。一般銨態氮施于6厘米以下土層，尿素施于10厘米以下土層。
3、配施生物氮肥，增施磷、鉀肥，配施生物氮肥是解決限用化學肥料的有效途徑之一，磷、鉀肥對增加蔬菜抗逆性有著明顯作用。
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